Distributed Computing team of Ukraine | Ukraine - Українська Команда Розподілених Обчислень | Ukraine - Украинская Команда Распределённых Вычислений - Описи проектівhttps://distributed.org.ua/index.php?go=Pages&in=view&id=50 |
Распечатать |
Проекти 2400-2420
Проекти 2400-2420
Проекти серії 24хх досліджують хімічне оточення рибосомного тунелю.
Рибосома - найбільш важливий природний ензим, що виконує функцію формування нових білків. Рибосома - це "фабрика", де "рецепт", зашифрований у ДНК, зчитується і переводиться в набір інструкцій, які будуть використані для зборки білків, що регулюють життєві цикли всіх живих клітин.
Горизонтальний зріз тунелю рибосоми (чорним позначені місця всередині тунелю, де буде апробована спорідненість) (с) зображення fah-web.stanford.edu
Рибосома - складний молекулярний пристрій, що складається з декількох компонентів, синхронізованих у часі, які забезпечують синтез і регулювання білків, що покидають клітини у вигляді ланцюжків поліпептидів через вихідний рибосомний тунель.
Як й у будь-якій спеціалізованій біологічній "машині", функціонування рибосоми може бути порушено, і, зрештою, зупинено різними агентами, деякі з яких націлені на механічні дії, порушення хімічних взаємодій, що викликають смерть клітини. Наприклад, деякі антибіотики та інші малі молекули прикріплюються до важливих ділянок вихідного тунелю і можуть блокувати рибосоми.
Внутрішня поверхня тунелю рибосоми та малі молекули, які можуть прикріплюватися під час симуляції (с) зображення fah-web.stanford.edu
У той же час, чутливість вихідного тунелю рибосоми така, що деякі послідовності амінокислот проводять більше часу в тунелі, що викликає вповільнений синтез і регулювання цих особливих білків.
Мета проекту - дослідити хімічне середовище всередині вихідного тунелю рибосоми, і його спорідненість у відношенні деяких малих молекул. Для цих цілей ми плануємо випробувати різні ділянки тунелю різними бібліотеками малих молекул.
| 23.01.2007 10:54